MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008378	CAG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248677
2	NC_008378	CGG	2	6	149	154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248677
3	NC_008378	GCC	2	6	202	207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248677
4	NC_008378	ACGG	2	8	236	243	25 %	0 %	50 %	25 %	116248677
5	NC_008378	CGA	2	6	288	293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248677
6	NC_008378	ATC	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248677
7	NC_008378	ACC	2	6	388	393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248677
8	NC_008378	CCT	2	6	467	472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248677
9	NC_008378	TCA	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248677
10	NC_008378	GAG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248677
11	NC_008378	GC	3	6	576	581	0 %	0 %	50 %	50 %	116248677
12	NC_008378	CGG	2	6	671	676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248677
13	NC_008378	ACG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248677
14	NC_008378	CGC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248677
15	NC_008378	ATGTC	2	10	836	845	20 %	40 %	20 %	20 %	116248677
16	NC_008378	TGACGA	2	12	860	871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116248677
17	NC_008378	GTCG	2	8	882	889	0 %	25 %	50 %	25 %	116248677
18	NC_008378	CGG	2	6	900	905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248677
19	NC_008378	ACG	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248677
20	NC_008378	CGG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248677
21	NC_008378	ATAG	2	8	1191	1198	50 %	25 %	25 %	0 %	116248677
22	NC_008378	GC	3	6	1202	1207	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
23	NC_008378	CG	3	6	1263	1268	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
24	NC_008378	CGG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248678
25	NC_008378	CTTC	2	8	1440	1447	0 %	50 %	0 %	50 %	116248678
26	NC_008378	CGAT	2	8	1453	1460	25 %	25 %	25 %	25 %	116248678
27	NC_008378	CGAT	2	8	1464	1471	25 %	25 %	25 %	25 %	116248678
28	NC_008378	GCA	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248678
29	NC_008378	CCGC	2	8	1537	1544	0 %	0 %	25 %	75 %	116248678
30	NC_008378	GC	3	6	1624	1629	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
31	NC_008378	GTC	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248678
32	NC_008378	GTC	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248678
33	NC_008378	TC	3	6	1699	1704	0 %	50 %	0 %	50 %	116248678
34	NC_008378	GC	4	8	1714	1721	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
35	NC_008378	TCA	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248678
36	NC_008378	GGC	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248678
37	NC_008378	GGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248678
38	NC_008378	GCC	2	6	1875	1880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248678
39	NC_008378	TCG	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248678
40	NC_008378	GAC	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248678
41	NC_008378	GC	3	6	1958	1963	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
42	NC_008378	CGA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248678
43	NC_008378	GAA	2	6	2011	2016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248678
44	NC_008378	GCG	2	6	2058	2063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248678
45	NC_008378	AAG	2	6	2078	2083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248678
46	NC_008378	CAA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248678
47	NC_008378	GC	3	6	2200	2205	0 %	0 %	50 %	50 %	116248678
48	NC_008378	GAC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248679
49	NC_008378	GCG	2	6	2387	2392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248679
50	NC_008378	GCA	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248679
51	NC_008378	GAC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248679
52	NC_008378	GC	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	116248679
53	NC_008378	GGC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248679
54	NC_008378	GGCC	2	8	2681	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	116248679
55	NC_008378	GC	3	6	2727	2732	0 %	0 %	50 %	50 %	116248679
56	NC_008378	CAGGG	2	10	2738	2747	20 %	0 %	60 %	20 %	116248679
57	NC_008378	TCGAAA	2	12	2800	2811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116248679
58	NC_008378	GCC	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248679
59	NC_008378	TGC	2	6	2845	2850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248679
60	NC_008378	CGG	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248679
61	NC_008378	GAA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248679
62	NC_008378	CTT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248679
63	NC_008378	CCG	2	6	2995	3000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248679
64	NC_008378	CAC	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248679
65	NC_008378	CGA	2	6	3020	3025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248679
66	NC_008378	GC	3	6	3038	3043	0 %	0 %	50 %	50 %	116248679
67	NC_008378	GTC	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248679
68	NC_008378	A	8	8	3080	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	116248679
69	NC_008378	ACGA	2	8	3226	3233	50 %	0 %	25 %	25 %	116248679
70	NC_008378	CGG	2	6	3257	3262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248679
71	NC_008378	TCC	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248679
72	NC_008378	GGA	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248679
73	NC_008378	GCC	2	6	3411	3416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248679
74	NC_008378	GTC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248679
75	NC_008378	CGC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248679
76	NC_008378	CGG	2	6	3545	3550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248679
77	NC_008378	GAT	2	6	3847	3852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248680
78	NC_008378	GAC	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248680
79	NC_008378	TTC	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248680
80	NC_008378	AGC	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248680
81	NC_008378	ATC	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248680
82	NC_008378	GCG	2	6	4031	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248680
83	NC_008378	GGCC	2	8	4042	4049	0 %	0 %	50 %	50 %	116248680
84	NC_008378	TCC	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248680
85	NC_008378	GTGA	2	8	4109	4116	25 %	25 %	50 %	0 %	116248680
86	NC_008378	ACA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248680
87	NC_008378	CGGC	2	8	4234	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	116248680
88	NC_008378	TCC	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248680
89	NC_008378	TGG	2	6	4344	4349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248680
90	NC_008378	CGA	2	6	4351	4356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248680
91	NC_008378	GGC	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248680
92	NC_008378	GGA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248680
93	NC_008378	CTG	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248680
94	NC_008378	CAC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248680
95	NC_008378	GGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248680
96	NC_008378	CGA	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248681
97	NC_008378	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248681
98	NC_008378	GCC	2	6	4789	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248681
99	NC_008378	TCG	2	6	4795	4800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248681
100	NC_008378	GAAG	2	8	4955	4962	50 %	0 %	50 %	0 %	116248681
101	NC_008378	AGC	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248681
102	NC_008378	CAT	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248681
103	NC_008378	TCAG	2	8	5185	5192	25 %	25 %	25 %	25 %	116248681
104	NC_008378	ACG	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248681
105	NC_008378	ATCA	2	8	5307	5314	50 %	25 %	0 %	25 %	116248681
106	NC_008378	CGA	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248682
107	NC_008378	ACG	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248682
108	NC_008378	GAG	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248682
109	NC_008378	AAC	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248682
110	NC_008378	AGC	2	6	5639	5644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248682
111	NC_008378	AGA	2	6	5648	5653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
112	NC_008378	GGCT	2	8	5740	5747	0 %	25 %	50 %	25 %	116248682
113	NC_008378	CGG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248682
114	NC_008378	GACC	2	8	5784	5791	25 %	0 %	25 %	50 %	116248682
115	NC_008378	GCG	2	6	5849	5854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248682
116	NC_008378	ACT	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248682
117	NC_008378	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248682
118	NC_008378	GTT	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248682
119	NC_008378	GAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
120	NC_008378	CGA	2	6	5939	5944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248682
121	NC_008378	GAA	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
122	NC_008378	TGC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248682
123	NC_008378	CCA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248682
124	NC_008378	TCG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248682
125	NC_008378	GAA	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
126	NC_008378	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
127	NC_008378	CGAT	2	8	6122	6129	25 %	25 %	25 %	25 %	116248682
128	NC_008378	TGA	2	6	6152	6157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248682
129	NC_008378	GCAAG	2	10	6219	6228	40 %	0 %	40 %	20 %	116248682
130	NC_008378	GCC	2	6	6261	6266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248682
131	NC_008378	CAT	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248682
132	NC_008378	CGT	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248682
133	NC_008378	AGA	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
134	NC_008378	AAG	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248682
135	NC_008378	CTG	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248682
136	NC_008378	GCCGGC	2	12	6460	6471	0 %	0 %	50 %	50 %	116248682
137	NC_008378	GTCC	2	8	6486	6493	0 %	25 %	25 %	50 %	116248682
138	NC_008378	CGT	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248682
139	NC_008378	TCA	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248682
140	NC_008378	CGG	2	6	6648	6653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248682
141	NC_008378	AGGA	2	8	6773	6780	50 %	0 %	50 %	0 %	116248683
142	NC_008378	ACT	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248683
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145	NC_008378	GAT	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
146	NC_008378	GAT	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
147	NC_008378	TCTCC	2	10	7181	7190	0 %	40 %	0 %	60 %	116248683
148	NC_008378	CATCGG	2	12	7193	7204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116248683
149	NC_008378	AGC	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248683
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152	NC_008378	CGG	2	6	7301	7306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248683
153	NC_008378	GGC	2	6	7310	7315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248683
154	NC_008378	CG	3	6	7321	7326	0 %	0 %	50 %	50 %	116248683
155	NC_008378	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
156	NC_008378	TGA	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
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158	NC_008378	GCA	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248683
159	NC_008378	CAT	2	6	7460	7465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248683
160	NC_008378	ATCT	2	8	7515	7522	25 %	50 %	0 %	25 %	116248683
161	NC_008378	CTA	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248683
162	NC_008378	TCT	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248683
163	NC_008378	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
164	NC_008378	TGA	2	6	7662	7667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248683
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167	NC_008378	TGA	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248684
168	NC_008378	GTC	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248684
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242	NC_008378	TTC	2	6	11281	11286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248687
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244	NC_008378	CAT	2	6	11496	11501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248687
245	NC_008378	CGA	2	6	11502	11507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248687
246	NC_008378	TGGG	2	8	11525	11532	0 %	25 %	75 %	0 %	116248687
247	NC_008378	AAG	2	6	11533	11538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248687
248	NC_008378	GAAG	2	8	11544	11551	50 %	0 %	50 %	0 %	116248687
249	NC_008378	CAAAC	2	10	11682	11691	60 %	0 %	0 %	40 %	116248688
250	NC_008378	CAA	2	6	11705	11710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248688
251	NC_008378	TTC	2	6	11760	11765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248688
252	NC_008378	GCG	2	6	11775	11780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248688
253	NC_008378	CCG	2	6	11855	11860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248688
254	NC_008378	CCGAT	2	10	11869	11878	20 %	20 %	20 %	40 %	116248688
255	NC_008378	GCG	2	6	11964	11969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248688
256	NC_008378	TC	3	6	11986	11991	0 %	50 %	0 %	50 %	116248688
257	NC_008378	TGG	2	6	12054	12059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248688
258	NC_008378	TCG	2	6	12085	12090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248688
259	NC_008378	CTT	2	6	12197	12202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248688
260	NC_008378	TTC	2	6	12204	12209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248688
261	NC_008378	GCTGC	2	10	12213	12222	0 %	20 %	40 %	40 %	116248688
262	NC_008378	CGCT	2	8	12234	12241	0 %	25 %	25 %	50 %	116248688
263	NC_008378	CGA	2	6	12316	12321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248688
264	NC_008378	TCA	2	6	12337	12342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248688
265	NC_008378	CAT	2	6	12374	12379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248688
266	NC_008378	ACC	2	6	12387	12392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248688
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269	NC_008378	CGC	2	6	12546	12551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248688
270	NC_008378	TCA	2	6	12622	12627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248689
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273	NC_008378	CGT	2	6	12707	12712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248689
274	NC_008378	ATC	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248689
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280	NC_008378	GAT	2	6	12923	12928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248689
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283	NC_008378	GTC	2	6	12981	12986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248689
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285	NC_008378	TCA	2	6	13021	13026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248689
286	NC_008378	CGGCAA	2	12	13042	13053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248689
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295	NC_008378	CGT	2	6	13265	13270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248689
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373	NC_008378	ACC	2	6	17314	17319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248694
374	NC_008378	TGA	3	9	17369	17377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248694
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378	NC_008378	TGA	2	6	17489	17494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248694
379	NC_008378	GGC	2	6	17535	17540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248694
380	NC_008378	ATC	2	6	17550	17555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248694
381	NC_008378	CGG	2	6	17568	17573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248694
382	NC_008378	GCT	2	6	17729	17734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248695
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